No dia seguinte à sua morte o Vereador Dr. Baêta Henriques, em reunião camarária, tinha comumicado a sua vontade de outorgar o nome de Gago Coutinho à Avenida do Aeroporto. A Comissão de Toponímia entendeu que “ o nome de Gago Coutinho seja atribuído a uma praça ou avenida de maior projecção do que a Avenida do Aeroporto e, possivelmente, junto ao Tejo, na freguesia da Ajuda ou Alcântara, onde aquele ilustre homem de ciência nasceu e viveu a maior parte da sua vida e partiu para a grande viagem que lhe deu renome Universal.” Em reunião de 23-06-1959 a Comissão aditou que “no entanto deixa ao superior critério do Excelentíssimo Presidente da Câmara a resolução do assunto.”
Finalmente a proposta inicial do Aero Club de Portugal de 23 de Julho de 1956, é concretizada em 1960 passando a Avenida que liga a Praça do Areeiro ao Aeroporto de Lisboa a designar-se de Avenida Almirante Gago Coutinho